腦發育不良的預防主要是進行婚前及產前檢查，以避免患兒的出生。具體預防措施如下所述。
1、首先要做的預防工作就是實行婚前保健：
預防腦發育不全，應從婚前開始，實行婚前保健。婚前保健包括：對準備結婚的男女雙方進行性衛生、生育和遺傳病知識的指導;有關婚配、生育等問題咨詢及男婦雙方可能患影響結婚和生育的疾病進行醫學檢查，提出醫學意見。
2、搞好孕期保健：
孕婦受孕后的280天，是胎兒在母體內吸取養分，逐漸發育成長的過程。遺傳、感染、營養不良以及其他理化因素，均可導致胎兒發育不良或致先天性缺陷，因而整個孕期的保健對于母嬰的健康都是十分必要的，特別是在妊娠后期，這種保健就顯得更為重要。
3、定期產前檢查：
定期到醫療、保健機構進行產前檢查，是保障母嬰健康的重大措施。
4、增加營養：
孕婦因自身和胎兒發育之需，消耗比一般人要大，故營養素的供給必須充足，這在妊娠的最后3個月尤為重要。妊娠后期，胎兒的發育不但迅速，而且又是大腦發育的關鍵時期，及時為孕婦提供豐富的蛋白質、脂肪、葡萄糖、核酸、維生素、微量元素，對胎兒的正常成長意義重大。
5、防止感染性疾病的發生：
孕期發生感染可致胎兒大腦受到損害。