內分泌失調不孕是指內分泌失調而導致的女性不孕，其實正常排卵周期的建立需下丘腦—垂體—卵巢軸功能正常。其中任何一個部位功能障礙都可能導致不排卵，因而引起無月經、月經稀發、功血等，進行可能導致不孕癥，由這種內分泌原因導致的不孕癥即內分泌失調性不孕。
醫學解釋，體內有內分泌系統，分泌各種激素和神經系統一起調節人體的代謝和生理功能。正常情況下各種激素是保持平衡的，如因某種原因使這種平衡打破了(某種激素過多或過少)這就造成內分泌失調，會引起相應的臨床表現。而內分泌失調是導致不孕癥的重要原因。
內分泌失調與情緒因素使女性下丘腦-垂體-卵巢性腺軸激素分泌過多或過少;新陳代謝功能紊亂等有關;以至于出現以下疾病造成不孕：排卵障礙、閉經、多囊卵巢綜合癥、多毛癥與男性化、高催乳血癥、黃體功能不全、功能性子宮出血、排卵期出血、卵巢功能不全、卵巢早衰等。其中排卵障礙比較常見，也是由于婦科疾病造成的。