我國肝癌的主要病因因素，有病毒性肝炎感染，食物中的黃曲霉毒素污染，以及農村中飲水污染。
1、肝癌患者中約有1/3的病人有慢性肝炎史，澳抗(HbsAg)陽性率明顯高于低發區，已發現丙型肝炎病毒感染和乙型的感染一樣，與肝癌發病有密切的關系，乙肝肝炎病毒和丙型肝炎病毒肯定是促癌因素之一。
2、肝癌患者中合并有肝硬化者約50%～90%，近年來發現丙型病毒性肝炎發展為肝硬化的比例不低于乙型肝炎。
3、實驗證明，黃曲霉素的代謝產物為黃曲霉毒素B1有強烈的致癌作用，存在于霉變的玉米，花生等食品中，食品被黃曲霉毒素B1污染嚴重的地區，肝癌的發病率也較高。亞硝胺類、偶氮芥類、酒精、有機氯農藥等均是可疑的致癌物質。
4、一些飲用水常被多氯聯苯、氯仿等污染，近年來發現池塘生長的藍綠藻是強烈的致癌植物，可污染水源。寄生蟲病如華支睪吸蟲感染可刺激膽管上皮增生，可導致原發性膽管癌。
5、長期酗酒是損害肝臟的第一殺手。這是因為酒精進入人體后，主要在肝臟進行分解代謝，酒精對肝細胞的毒性使肝細胞對脂肪酸的分解和代謝發生障礙，引起肝內脂肪沉積而造成脂肪肝。