男性病人感染之后，可以有1～2周的潛伏期。主要發生尿痛、尿道口癢或有燒灼感;尿道口會有少量稀薄的粘液或膿性分泌物，晨起也會有“糊口”現象，并可有輕度紅腫。
女性大部分人雖然被感染但無明顯癥狀，少部分人可有尿痛，尿頻癥狀，宮頸糜爛、紅腫，白帶增多，陰道、外陰刺癢以及小腹不適感，有50%以上的人在被感染后不表現出任何癥狀，易被漏診。
女性淋病性尿道炎臨床表現1、急性淋病性尿道炎，潛伏期1～3天。主要癥狀有外陰部瘙癢，尿道口潮紅，粘膜水腫，尿道口流出黃色膿性分泌物，輕度尿頻、尿痛、尿急。
女性淋病性尿道炎臨床表現2、慢性淋病性尿道炎，一般急性淋病兩周后炎癥反應可以完全消失，但淋菌仍舊存在。長期潛伏于尿道旁腺、子宮頸腺體、輸卵管皺褶處，待機復發。臨床癥狀很輕，分泌物很少或無，一般不易發現，常成為帶菌者，也是男性淋病主要傳染者。
女性淋病性尿道炎臨床表現3、女陰及前庭炎，淋球菌侵及尿道及子宮頸時，則由陰道和尿道流出的膿液，刺激外生殖器皮膚及陰道前庭粘膜發生炎癥現象，實為一種繼發感染現象，而不是由淋菌直接感染所致。主要癥狀為陰唇潮紅水腫，表面濕潤、糜爛，尿道旁側腺管——Skene氏腺炎，腺口粘膜紅腫，壓之自開口處有少量膿液流出，有腺管被分泌物堵塞時可形成膿瘍一一假性膿瘍。自覺局部瘙癢及灼熱感，排尿時疼痛。
除根據病史及體征外，需將尿道分泌物行涂片染色檢查或細菌培養，以明確致病菌。男性病人若無尿道分泌物，應進行三杯試驗(即前尿道炎第1杯尿渾濁有大量膿細胞白細胞，第23杯清晰后尿道炎，第13杯渾濁有大量膿細胞白細胞第2杯清晰)急性期尿道內忌用器械檢查。慢性尿道炎需行尿道膀胱鏡檢查以便明確發病的原因，有時可用金屬尿道探條試探尿道內有無狹窄。必要時行尿道造影。