兒童敗血癥的原因是由于其防御機制不成熟，屏障功能差，如兒童皮膚角化層、真皮層薄，膠原纖維疏松，黏膜柔嫩，通透性高，呼吸道纖毛運動弱和腺體分泌不全等因素均有利于細菌由皮膚、呼吸道、消化道黏膜侵入血液。兒童免疫功能不足，使感染后局限能力差，侵入的細菌易于血中繁殖、散播，發展成敗血癥。
誘發兒童敗血癥的病因
1、年齡愈小，機體免疫功能愈差，局部感染后局限能力愈弱，極易導致感染擴散。
2、由于小兒時期皮膚粘膜柔嫩、易受損傷，血液中單核吞噬細胞和白細胞的吞噬功能差，血清免疫球蛋白和補體水平亦低，為敗血癥的發生創造了條件。
3、營養不良、先天性免疫缺陷病、腎病綜合征患兒應用糖皮質激素治療時、白血病和腫瘤患兒用化療或放療時等均可因機體免疫功能低下而引發敗血癥。