事實上、有20%的硬化癥病人并無癥狀、而是在死後解剖發現大腦有其病灶。85%硬化癥病患初發時以反覆復發緩解來表現;其中30%進展為二次性進展型硬化癥、之前反覆復發緩解的病程趨緩。10%病患屬于原發性進展型硬化癥、無法看到明確緩解的病程、而是自病程開始便持續惡化、其預後亦最差。
因硬化癥會侵犯神經纖維的髓鞘、故臨床癥狀端看受損神經纖維為何而決定。一般而言、運動、感覺、以及視覺的影響都很常見;若腦干及小腦系統的神經纖維受損、復視、吞咽困難、步履不穩、暈眩的癥狀亦可能發生。如果脊髓發炎、除了運動、感覺功能外、排泄的功能亦發生障礙。
癥狀的復發在起始、常是單獨的癥狀、意指只有單獨的神經系統受損。癥狀的發生、常在幾小時至幾天才發生完全。依照定義、癥狀要持續24到48小時;如果是陣發性癥狀、必須持續數星期才合乎診斷要件。96%病患在第一次發作常完全緩解、不過在第一次發作後、25%病患一年內會再發生;40%病患五年內會再發生。無論如何、在病程後期復發的頻率逐漸減少。由反覆復發緩解型進展為二次性進展型硬化癥的特征，85%硬化癥病患、初發時以反覆復發緩解來表現。其中30%進展為二次性進展型。