總體來說，肛周膿腫的病因方面比較復雜，多數情況下都是感染因素所引起，但其他方面也有致病因素，當然，針對一種疾病的預防，最為基礎的方面就是及時掌握疾病的相關知識。比如病因方面等。下面，就肛周膿腫的預防方式進行介紹：
1.積極防治其他肛腸疾病，如肛竇炎、肛乳頭肥大、肛裂、炎性痔、直腸炎等能及時、正確、有效的治療，可以避免和減少肛周感染，膿腫和肛瘺的發生。
2.防治便秘和腹瀉，對預防肛門直腸周圍感染有重要意義，它能避免和減少肛門直腸區的粘膜和上皮組織的損傷或炎癥，可降低膿腫與肛瘺的發病率。
3.一旦發生肛門直腸周圍感染，應及早到正規的醫院診治，并采用有效的抗感染措施，包括全身及局部的治療，可防止炎癥蔓延、擴散，切勿輕信游醫成所謂“祖傳”的宣傳而延誤診斷及治療。
4.保持肛門部清潔衛生，勤換內褲，堅持每日便后清洗肛門，對預防感染有積極作用。避免腹瀉與大便干燥，刺激肛隱窩發炎誘發肛周膿腫，因而防治便秘和腹瀉對預防肛周膿腫形成具有重要意義。
5. 便秘會讓肛門充血和干燥大便摩擦肛門。有的人則是因為怕肛門不干凈，反復擦拭肛門，部分患者因為肛門括約肌薄弱、肛管短，在擦拭過程中易使肛門黏膜外翻，肛竇暴露在肛門外，同時受到機械刺激，使之充血、水腫，進而感染發炎，形成肛竇炎，肛竇炎可發展成肛門膿腫。所以在便完后，應用溫水洗浴肛門，用柔軟、干凈的舊毛巾，沾去肛門周圍皮膚的水珠，而不是去擦肛門，更不應該使用粗硬的劣制衛生紙用力去擦肛門。
6.及時治療可引起肛門直腸周圍膿腫的全身性疾病，如潰瘍性結腸炎、腸結核、克隆氏病等。
7. 少吃辛辣刺激性食品，特別是夏季，冷飲生食常常引起腹瀉從而導致膿腫的發生，平時鍛煉身體，增強體質，久坐久站的人肛門局部血液循環易發生障礙，降低了局部的抗病能力，容易發生感染。所以，久坐之人要積極參加體育運動，增加肛門部的抗病能力。不要久坐濕地，在草地、濕土上久坐，肛門部受涼受濕，降低了抗病能力，寒濕之邪容易侵入肛門，引起感染。