三尖瓣下移畸形手術存在以下風險，有可能造成并發癥：
(一)血栓形成
1.原因：折疊縫合房化右心室，打結后形成部分“囊袋”，使血液滯留而形成血栓。如施行機械瓣置換術，則更易形成血栓。
2.對策：要求手術者掌握正規操作技術，折疊縫合的第一個帶小墊片雙頭針，從后瓣下移的最低點、右心室心肌淺層進針，兩針分別在房化右心室內穿過心肌。作4～5個連續縫合后，到達冠狀靜脈竇口的前內方(避開Koch三角)接近正常瓣環處出針，兩針各穿過小墊片。進出針既不可穿透房化右心室壁，又必須掛上心肌組織，要求牢固可靠，瓣環處的針距應大于瓣葉附著最低處的針距，打結后可起到縮小瓣環的作用，以相同方式呈放射狀縫4～5對雙頭針褥式縫線，緊線打結，這樣可消除“囊袋”現象。
如應用人造機械瓣行三尖瓣置換術，則術后必須進行抗凝治療。
(二) 三尖瓣關閉不全
1.原因：三尖瓣下移患者多同時存在三尖瓣發育不良，因瓣葉有裂孔和瓣環擴大而產生關閉不全;單純折疊術后三尖瓣環仍較大，其前瓣葉蓋不住瓣口。
2.對策：如有上述情況則需作節段性De Vega 瓣環成形術或瓣環支架成形術，褥式縫合前葉及后葉交界處，以縮小瓣環等，加以修補，如注水測試仍有明顯關閉不全，則應果斷地施行三尖瓣置換術。
(三) 三尖瓣置換術存在的問題
三尖瓣嚴重下移，前瓣葉增厚、瓣下結構發育不良、房化右心室僵硬，則不宜作折疊成形，必須行三尖瓣置換術。手術方法與常規三尖瓣置換術相同。可能存在的問題：
1.置入何種人工瓣膜;當前一般認為選用低架牛心包瓣為好，只須短期服用抗凝藥物，血栓形成的機會較少。也可用St. Jude雙葉瓣。成人用29~31號，小兒25~27號，需終生抗凝。
2.人造瓣縫到何處：如房化右室及瓣環都很大，可折疊減小部分房化右室，即將折疊縫線縫到人工瓣上，收緊縫線結扎。
3.傳導阻滯：將冠狀靜脈竇口縫置于右心室。