1、甲類傳染病
甲類傳染病也稱為強制管理傳染病，包括：鼠疫、霍亂。
對此類傳染病發生后報告疫情的時限，對病人、病原攜帶者的隔離、治療方式以及對疫點、疫區的處理等，均強制執行。
2、乙類傳染病
乙類傳染病也稱為嚴格管理傳染病，包括：傳染性非典型肺炎、艾滋病、病毒性肝炎、脊髓灰質炎、人感染高致病性禽流感、麻疹、流行性出血熱、狂犬病、流行性乙型腦炎、登革熱、炭疽、細菌性痢疾、阿米巴性痢疾、肺結核、傷寒和副傷寒、流行性腦脊髓膜炎、百日咳、白喉、新生兒破傷風、猩紅熱、布魯氏菌病、淋病、梅毒、鉤端螺旋體病、血吸蟲病、瘧疾、甲型H1N1流感(原稱人感染豬流感)。
對此類傳染病要嚴格按照有關規定和防治方案進行預防和控制。其中，傳染性非典型肺炎、炭疽中的肺炭疽、人感染高致病性禽流感和甲型H1N1流感這四種傳染病雖被納入乙類，但可直接采取甲類傳染病的預防、控制措施。
3、丙類傳染病
丙類傳染病也稱為監測管理傳染病，包括：流行性感冒、流行性腮腺炎、風疹、急性出血性結膜炎、麻風病、流行性斑疹傷寒、地方性斑疹傷寒、黑熱病、包蟲病、絲蟲病，除霍亂、細菌性和阿米巴性痢疾、傷寒和副傷寒以外的感染性腹瀉病。
對此類傳染病要按國務院衛生行政部門規定的監測管理方法進行管理。2008年5月2日，衛生部已將手足口病列入傳染病防治法規定的丙類傳染病進行管理。