不同錯頜畸形矯治的最佳年齡有所不同。
在乳牙期(3～5歲)和替牙期(6～11歲)，一般的錯頜畸形如個別牙齒錯位不需要立即矯治，應當繼續(xù)觀察和糾正口腔不良習慣。因為在這個時期，牙頜正處于調整時期，隨著不良習慣的糾正，錯頜畸形常可以部分自行糾正。這時的生長發(fā)育速度很快，不適當?shù)某C治力會影響發(fā)育。但是，對于嚴重妨礙生長發(fā)育的錯頜畸形，則需要進行初步的矯治。
如乳牙反頜，會妨礙上頜骨的發(fā)育，影響面部的外形，應當及早治療。如果孩子能配合，在3～5歲都可矯治。又如嚴重下頜后縮，在替牙期(7～10歲)就可進行早期矯治，以阻斷其向嚴重發(fā)展，也為以后繼續(xù)矯治減小難度。恒切牙的重度扭轉也可在替牙期矯治。
大多數(shù)的錯頜畸形要等到牙齒替換完的恒牙期，大約12～14歲才進行矯治。因為這時恒牙牙根逐漸發(fā)育完成，上下牙齒間的咬合關系也調整完成，可以對錯頜畸形的類型做出明確診斷，并采取相應的矯治方法。矯治完成后容易保持穩(wěn)定的效果，不會再有大的變化。
兒童矯治錯頜畸形的最佳年齡是在兒童的生長發(fā)育高峰期，男孩在12～14歲，女孩在11～13歲。在這個時期進行矯治，療程短，效果好。
錯過這個時期，到了15～17歲，仍處于青少年期，生長發(fā)育仍然比較活躍，雖然難度略有增加，但矯治效果也比較好。如果到了18歲以后，進人成人期，生長發(fā)育基本完成，矯治效果就不如兒童期和青少年期。
對于嚴重的骨性錯頜畸形，不能單純用正畸的方法來完成矯治，必須等到18歲以后的成人期配合外科手術來進行治療。