先天性麻痹性斜視的寶寶很小時家長會發現孩子看東西歪頭，斜視度大的孩子家長容易發現，帶孩子到眼科就診，這樣的孩子不容易耽誤病情，一些斜視度比較小的孩子，主要是歪頭視物。那么，如何治療先天性麻痹性斜視好呢?
眼科專家介紹說，我們通常鑒別孩子是不是由于眼科斜視引起的歪頭，在臨床上有一個最簡單的方法就是把孩子的一只眼睛用紗布遮住，遮蓋后如果孩子的歪頭癥狀減輕或者消失，這時應該高度警惕先天性斜視造成的代償頭位。
治療新鮮麻痹性斜視除針對病因治療外，同時可口服和肌注維生素B1、維生素B12、肌苷、輔酶A、ATP等。還可作針灸、理療促進麻痹肌的恢復。治療半年后不能恢復，可考慮手術治療。
對于上斜度數小的患者，我們可以考慮使用三棱鏡矯正代償頭位。
斜視度較大的患兒，應該早期考慮手術治療。這種先天性麻痹性斜視的手術，國外的眼科醫生主張分次手術，我們對于家住比較近的孩子，以及經濟情況比較好的患兒多采取分次手術。對于家住邊遠地區。和經濟情況比較差的患兒，爭取一次手術解決問題。可是這樣增加了手術難度。手術的設計我們手術前一定要仔細和家長進行溝通和談討，爭取得到家長的理解和配合。
先天性兒童麻痹性斜視，仍以手術治療為主，因為先天性麻痹性斜視形成弱視機會不多，雙眼單視功能往往因為代償頭位而保持;即使雙眼單視功能不健全或喪失，只要手術時間早，手術后眼位得以矯正，代償頭位很快會消失，雙眼單視功能也會很快恢復，達到功能性治愈的目的。
專家提醒，兒童麻痹性斜視引起的“眼性斜頸”會產生許多的并發癥，比如脊柱的發育異常，牙齒，面頰的發育異常，年齡較大的麻痹性斜視的孩子通過手術可以矯正斜視，可是卻遺留永久的面頰，脊柱，牙齒的發育異常，因此存在代償頭位的兒童應盡早手術矯正。