慢性胃炎的治療除了在飲食規律和生活方式上注意外，還要進行正確的藥物治療，以緩解臨床癥狀，提高生活質量，并預防胃癌的發生。慢性胃炎的藥物治療主要有以下幾個方面：
1、根治幽門螺桿菌
幽門螺桿菌感染引發的胃炎，有效根治細菌可以明顯減輕癥狀，并阻止病情惡化，直至治愈。根治幽門螺桿菌的方法很多，目前公認的三聯療法療效好、療程短、花費適中。三聯包括：質子泵抑制劑(奧美拉唑、蘭索拉唑等)、第一抗生素(克拉霉素、阿莫西林等)、第二抗生素(甲硝唑、替硝唑、奧硝唑、痢特靈等)。療程 7～14天，治愈率可達85%～90%。
2、保護胃黏膜
慢性胃炎是一種胃黏膜損害。胃黏膜保護藥物可在胃黏膜表面形成保護膜，隔離并吸附有害物，同時加速胃黏膜的修復。
3、胃腸動力藥、抑酸藥及消化藥
對于早飽、腹脹、反酸的患者，可用胃腸動力藥，如嗎丁啉。慢性胃炎患者不一定都有高胃酸，但對抑酸藥的反應普遍較好。常用藥物包括H2受體拮抗劑和質子泵抑制劑。腹脹明顯的患者，也可加服助消化藥，如消化酶制劑多酶片、乳酶生、干酵母片等均可選用，也可加服二甲基硅油。