急性胰腺炎的正確診斷率近年來有顯著提高，但在非典型的病例中，往往易與其他急性腹部疾患相混淆，故應隨時提高警惕，現將鑒別要點略述如下。
1.急性膽囊炎、膽石病急性膽囊炎的腹痛較急性胰腺炎輕，其疼痛部位為右上腹部膽囊區，并向右胸及右肩部放射，血尿淀粉酶正常或稍高;如伴有膽道結石，其腹痛程度較為劇烈，且往往伴有寒戰、高熱及黃疸。
2.膽道蛔蟲病膽道蛔蟲病發病突然，多數為兒童及青年，開始在上腹部劍突下偏右方，呈劇烈的陣發性絞痛，患者往往自述有向上“鉆頂感”。疼痛發作時，輾轉不安、大汗、手足冷，痛后如常人。其特點為“癥狀嚴重，體征輕微”(癥狀與體征相矛盾)。血尿淀粉酶正常，但在膽道蛔蟲合并胰腺炎時，淀粉酶可升高。
3.胃及十二指腸潰瘍穿孔潰瘍病穿孔為突然發生的上腹部劇烈疼痛，很快擴散至全腹部，腹壁呈板狀強直，腸音消失，肝濁音縮小或消失。腹平片有氣腹存在，更可能幫助明確診斷。
4.急性腎絞痛有時應與左側腎結石或左輸尿管結石相鑒別。腎絞痛為陣發性絞痛，間歇期可有脹痛，以腰部為重，并向腹股溝部與睪丸部放射，如有血尿、尿頻、尿急，則更有助于鑒別。
5.冠心病或心肌梗死在急性胰腺炎時，腹痛可反射性放射至心前區或產生各種各樣的心電圖改變，往往相混淆。然而，冠心病患者可有冠心病史，胸前區有壓迫感，腹部體征不明顯等，須仔細鑒別。