任何手術都有一定的風險，電視胸腔鏡下胸交感神經切斷術治療手汗癥也不例外，會出現術中出血并發癥的產生，通常是分離胸交感神經鏈時來自肋間靜脈或奇靜脈屬支的損傷，但也有來自于手術時套管針進入胸腔處的出血，包括肋間血管撕破等。
因此手術期間在切斷右胸交感T3或T4神經干時一定要注意，因為右胸交感T3或T4神經干更貼近奇靜脈屬支，其表面往往有縱橫交錯呈爪狀的小靜脈穿過，操作不慎就會損傷到這些小靜脈而導致出血，因此操作時要非常小心。操作方法主要有兩種，一種是先在靠近神經干的兩側無血管區域(有時僅電凝鉤大小區域)電灼壁層胸膜，然后將隱約可見的神經干用電凝鉤頭挑出，用電灼切斷;另一種是先在神經干的一側用電凝鉤稍用力將神經干向另一側推移，邊電灼邊旋轉，也可挑出神經干。
一般來說，只要醫生經驗豐富，定位準確，可避免出現術中出血。當然即使是出現術中出血了，也不可慌亂盲目燒灼電凝，應立即用內鏡鉗鉗夾電凝止血，或夾取小紗布球壓迫止血，一般均可成功。