有以下幾個原因：遺傳因素，基因異常是自然流產最常見的原因，早期流產時染色體異常者占50%-60%。而染色體異常可分為數目異常和結構異常。母體因素，孕婦患某些疾病，如急性傳染病可使胎兒死亡、流產。黃體功能不全、甲狀腺功能低下或亢進、糖尿病都可影響蛻膜、胎盤、胎兒的發育而流產。如為此種因素應積極治療原發病，或妊娠期間用藥控制病情使之穩定達到預防流產的目的。免疫因素，妊娠后由于母兒雙方免疫不適應而導致母體排斥胎兒以至流產。臨床上常檢查的有血型抗體、抗心磷脂抗體、抗卵巢抗體、抗子宮內膜抗體、抗精子抗體等。如有此類免疫因素存在，應針對病因施治。待免疫因素消除后再次妊娠。