指甲上有凹陷小坑可能由以下原因導致：一是低氧血癥，二是銀屑病，三是真菌感染。

一、低氧血癥：當機體出現缺氧情況時，會使動脈氧分壓下降，進而導致末梢組織循環缺氧。這種缺氧狀態會對指甲產生影響，容易致使指甲凹陷。同時，高強度的體力勞動也可能對指甲造成損害，引發指甲凹陷現象。

二、銀屑病：一旦患上銀屑病，指甲往往會出現不良的反應，有時就會容易引起指甲上出現凹陷小坑的情況。

三、真菌感染：在受到真菌感染后，指甲會遭到真菌的侵害，也容易引起指甲變形，包括出現凹陷小坑。

通常需要盡快前往醫院的皮膚科就診，然后依據診斷結果實施具有針對性的治療方案，這樣可以緩解指甲上有凹陷小坑的狀況。同時，還應該注重自身衛生，避免食用刺激性食物，以免對指甲造成不良影響。

指甲出現凹陷小坑可能是低氧血癥、銀屑病或真菌感染引起，應及時就醫診斷并針對性治療，還要注意個人衛生和飲食。