六歲兒童發燒39℃，可通過以下方法來處理：

一、使用退燒藥

六歲兒童發燒39℃時，一般可在醫生指導下口服對乙酰氨基酚口服溶液或布洛芬混懸液等退燒藥，以實現緊急退燒的目的。與此同時，還要注意讓孩子多喝溫開水，這樣能促進排汗，進而有助于退燒。

二、物理降溫

在服用退燒藥后，如果體溫沒有迅速上升，并且孩子沒有哭鬧或寒戰等情況，通常可以采取洗溫水澡、貼退熱貼或者溫水擦浴等方式來進行物理降溫。

1.洗溫水澡：通過溫水的作用來幫助散熱。

2.貼退熱貼：可貼在孩子額頭等部位，起到一定降溫作用。

3.溫水擦浴：用溫水擦拭孩子身體的某些部位，促進熱量散發。

三、針對病因治療

六歲兒童發燒39℃的原因有很多，需要針對具體病因進行治療。比如若是支原體感染且清除不徹底而導致的高燒，可在醫生指導下，按足療程使用阿奇霉素等藥物進行治療。

總之，六歲兒童發燒39℃時，應及時前往醫院就診，明確病因后進一步采取相應的治療措施。