中樞神經感染的主要病因是生物病原微生物感染，包括病毒、細菌、立克次體、螺旋體、真菌、寄生蟲等。其進入中樞神經系統主要有以下三種途徑：

一、血行感染：

1.病原體可在昆蟲叮咬、動物咬傷致皮膚黏膜損傷后進入血液，也可通過使用不潔注射器、輸血等直接進入血液。

2.面部感染時，病原體可經靜脈逆行入顱。

3.孕婦感染的病原體能經胎盤傳給胎兒。

二、直接感染：病原體可通過穿透性外傷或鄰近結構的感染向顱內蔓延。

三、逆行感染：像單純皰疹病毒、狂犬病毒等嗜神經病毒，會先感染皮膚、呼吸道或胃腸道黏膜，然后經神經末梢進入神經干，再逆行進入顱內。其主要臨床表現有發熱、頭痛、嘔吐、頸強直、癇樣發作、意識障礙等。在治療上主要選擇合適的抗病原微生物藥物，同時配合對癥支持治療。

中樞神經感染由生物病原微生物導致，其進入途徑多樣，臨床表現明顯，治療主要依靠抗病原微生物藥物與對癥支持治療。