小孩子陰莖疼的常見原因包括龜頭包皮炎和外傷等。

一、龜頭包皮炎：這在臨床中較為常見。如果小孩子不注重個人衛生，就可能導致細菌感染，從而容易引發龜頭包皮炎。通常還伴有包皮過長的情況，其表現為龜頭部位紅腫，包皮腔內可能有膿性分泌物等。治療方面可以使用的藥物如下：

1.紅霉素軟膏：可用于局部涂抹，起到抗菌消炎的作用。

2.阿莫西林、頭孢等抗生素類藥物：有助于消除炎癥。

二、陰莖外傷：如果是外傷致使小孩子陰莖疼痛，但沒有其他顯著癥狀且排尿正常，可以先密切觀察病情變化，暫時不進行特殊治療。而要是局部有裂口、出血等情況，可以先采用碘伏進行消毒，然后用紗布包扎止血，并及時就醫。

以上所提及的藥物僅供參考，具體的使用都應在醫生的指導下進行。總之，當小孩子出現陰莖疼時，要及時明確原因，根據具體情況選擇合適的治療方法。