巧克力囊腫不及時治療可能引發痛經、性交痛、月經異常、不孕不育、惡變及其他并發癥，后果嚴重，應早發現、早治療。

1.痛經和性交痛：巧克力囊腫會導致子宮收縮，引起痛經。性交時，由于囊腫觸碰，可能會加重疼痛。

2.月經異常：巧克力囊腫可能導致月經周期紊亂、經量過多或經期延長等問題。

3.不孕不育：巧克力囊腫可導致輸卵管粘連、堵塞，影響卵子的排出和受精，從而增加不孕的風險。

4.惡變風險：巧克力囊腫雖然是良性病變，但存在一定的惡變幾率，長期不治療可能會增加惡變的風險。

5.其他并發癥：巧克力囊腫還可能引發其他婦科疾病，如子宮內膜異位癥、盆腔炎等。

因此，對于巧克力囊腫，應早發現、早治療，以免延誤病情，造成不可挽回的后果。