男性生殖器皰疹的治療包含一般治療、系統用藥以及外用藥物。

一、一般治療：要注重休息，避免飲酒、勞累以及過度的性生活。當出現臨床癥狀，比如疼痛或是生殖器處有簇集、散在的小水皰時，就必須避免性生活。

二、系統用藥：

1.初發者可依據醫囑使用阿昔洛韋等抗病毒藥物；

2.對于復發型可采用間歇療法，也就是在出現前驅癥狀之前就開始進行治療。

三、外用藥物：

1.可選用以抗病毒、收斂、干燥以及防止繼發感染為主的藥物，比如按照醫囑使用3%阿昔洛韋軟膏或爐甘石洗劑；

2.當繼發感染時，可依據醫囑應用夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏；

3.要是有合并齦口炎，則應保持口腔清潔，外用口腔含漱液。

總之，以上所有用藥都需要在醫生的指導下進行，而且出現男性生殖器皰疹的患者應當及時就診，通過積極治療并改善生活方式，有希望使皰疹不再復發。