5歲寶寶睡覺磨牙的原因及處理方式如下：

一、牙齦炎及齲齒：這是較為常見的原因。寶寶可能會出現牙齦疼痛、食欲下降等情況。此時應及時帶寶寶去醫院，醫生一般會根據具體情況適當進行抗感染治療等，比如使用頭孢克洛等藥物，這樣能明顯改善癥狀。

二、微量元素缺乏：特別是鈣、鐵的缺乏。通常會伴有生長發育落后、多汗、腿疼以及貧血、注意力不集中等表現。建議完善鈣離子、游離鐵以及鐵蛋白等相關檢查來明確。一旦確診，要及時補充鈣元素和鐵元素，比如讓寶寶多喝牛奶、多吃動物性食物以及動物內臟等，這有利于促進癥狀的改善。

三、腸道寄生蟲感染：尤其與蛔蟲、饒蟲等有關。一般會有消瘦、食欲下降以及腹痛等伴隨癥狀。這種情況下需要及時進行驅蟲處理，例如使用阿苯達唑等藥物。

總之，當發現5歲寶寶睡覺磨牙時，要注意查找原因并采取相應的處理措施，以保障寶寶的健康。