孕后期臀部兩側骨頭痛，主要與以下原因相關：

一、胎兒或羊水負荷過重：在孕后期，胎兒不斷發育長大以及羊水增多，會導致后側骶髂關節承受的負荷過重，從而引發骶髂關節周圍出現炎癥，進而導致此處疼痛。

二、骨質疏松：因為胎兒的生長會大量消耗母體內的鈣質，如果孕婦在此時營養跟不上，就很容易出現骨質疏松的情況，之后就可能在腰椎、骨盆以及下肢等部位產生骨性疼痛。

三、肌肉疲勞：孕婦在孕期長期挺起腹部，會使臀部以及腰骶部位的肌肉出現疲勞，進而產生酸痛感，有時會讓孕婦誤以為是骨性疼痛。

四、周圍神經病變：在妊娠后期可能會出現腰椎間盤突出或者坐骨神經痛等周圍神經病變，從而引起此處放射性疼痛，讓孕婦誤以為是骨性疼痛。

孕后期臀部兩側骨頭痛可能由多種原因引起，包括胎兒及羊水負荷、骨質疏松、肌肉疲勞和周圍神經病變等，需要注意區分具體情況。