牙有窟窿的治療方式包括補牙治療、根管治療以及拔牙等。

一、補牙治療：當牙有窟窿時，多為齲齒所致，這主要是由細菌感染引發，導致牙體硬組織遭到破壞。對于輕度齲齒情況，可先去除牙齒的壞死組織，然后采用樹脂等材料進行補牙處理，這樣能有效改善牙齒狀況。

二、根管治療：若伴有牙髓組織明顯損傷，此時則適宜采用根管治療。通過該治療可清理根管內的感染物，同時還要做好局部的消毒以及墊底等操作。

三、拔牙：要是癥狀極為嚴重，只剩下少量殘根，通常牙齒已無保留價值，那就需要采取拔牙措施。在拔牙后后期，還可選擇種植牙的方式來進行修復，以維持牙齒的正常功能。

此外，還應堅持早晚刷牙、飯后漱口，如此可減少口腔內的細菌滋生。

總之，牙有窟窿時要根據具體情況選擇合適的治療方法，同時日常要注意口腔衛生護理。