滴眼藥水后眼睛疼的原因主要包括以下這些：

一、部分滴眼液自身的因素：

1.某些中成藥的滴眼液含有粉末狀物，會產生顆粒狀，滴入結膜囊內會有異物感，刺激角膜表面的上皮神經從而產生刺痛感，這種情況大約持續5至10分鐘會緩解。同時，某些西藥成分的滴眼液刺激性也較強，同樣會產生異物感，大概滴藥后10分鐘左右能自行緩解；

二、眼睛本身的狀況：當眼睛局部有炎癥時，會刺激眼部出現超敏反應，導致眼睛有異物感；

三、滴眼液的溫度問題：當局部滴眼液溫度過低時，也會刺激角膜產生異物感覺。

如果滴上眼藥水后眼睛疼，觀察一段時間后持續不能緩解，就應及時前往正規醫院眼科進行檢查治療，切不可延誤病情而耽誤治療。

滴眼藥水后眼睛疼可能由多種原因引起，要注意區分具體情況，如有異常且不緩解應及時就醫處理。