牙齒上有小黑點的原因包括以下方面：

一、色素沉著：長期有喝濃茶、濃咖啡、可樂或吸煙等習慣，容易致使牙齒出現茶漬、煙漬、咖啡漬等情況，表現為黑斑點。這些色素斑點通常會沉積在較難清理的縫隙內，一般需要通過超聲洗牙的方式來去除。

二、齲齒：

1.淺齲：牙齒表面僅有黑點，沒有齲洞，牙菌斑尚未對牙釉質造成侵害，通?？梢阅サ艉邳c后進行樹脂填充，以防止淺齲發展為中齲或深齲。

2.傷及牙髓：在少數情況下，牙齒表面一個小黑點，卻已經傷及牙髓甚至出現死髓牙，可能會有牙齒顏色改變，在X光片下可表現為陰影，建議進行根管治療，治療后可選擇樁冠修復或嵌體修復。

總之，牙齒有黑點時建議及時就醫，明確病因，在醫生的指導下盡早進行有針對性的治療，避免因治療不及時而導致失去患牙。