眼睛有濾泡是否能自愈需具體分析原因。如果是因眼睛過度疲勞導致，有自愈可能；若因結膜炎引起，則不會自行痊愈。

一、因用眼過度、眼睛疲勞導致眼睛有濾泡時，若采用熱蒸汽濕敷或熏蒸促進眼部淋巴循環，這種情況可能自愈。

1.用眼過度會使眼睛出現濾泡。

2.通過特定方法可促進恢復。

二、若濾泡是由濾泡性結膜炎導致，即眼結膜受細菌或病毒感染，結膜組織出現濾泡形成，此時濾泡不會自行痊愈。

1.濾泡性結膜炎會造成濾泡且不能自愈。

2.應配合相應治療，如使用阿昔洛韋滴眼液、更昔洛韋凝膠、普拉洛芬滴眼液等藥物，嚴重時可請專業醫生進行濾泡刮除，否則可能形成瞼結膜瘢痕化，引發嚴重干眼癥，導致后續治療更棘手。

總之，眼睛有濾泡能否自愈，要根據具體情況來判斷。