多發性肝囊腫通常沒有所謂的最佳治療方法，患者需及時就醫，依據醫生建議并結合囊腫大小選擇合適的治療方式，比如藥物治療或手術治療等。以下是具體情況：

一、囊腫直徑小于3厘米時：

1.多發性肝囊腫屬于良性囊性病變，在剛出現多發性肝囊腫時，一般無臨床癥狀。但當囊腫直徑達到3厘米左右時，患者可能會出現嘔吐、腹脹、腹痛等表現。

2.此時患者應盡快前往醫院，在醫生指導下可應用甲苯咪唑、阿苯達唑等藥物來進行輔助治療。

二、囊腫直徑大于3厘米時：

1.當多發性肝囊腫患者出現囊腫破裂、腎功能損害等并發癥時，就需要根據醫生的建議進行手術治療，手術方式包括開腹手術、肝切除術、肝切除聯合囊腫開窗術等。

總之，對于多發性肝囊腫患者，應及時就醫并遵醫囑進行相應處理。