肛瘺的最佳治療時機在于瘺管剛形成之時。肛瘺主要依靠手術來治療，且越早手術效果越佳，當肛瘺瘺管剛形成時，能通過探針準確找到肛瘺內口，此時手術效果最好，也不容易復發。而大部分肛瘺是由肛門直腸周圍膿腫引發的。

一、肛門直腸周圍膿腫自然破潰后，尚未形成肛瘺，內口不明確，進行手術時可能難以精準找到內口，進而導致術后容易復發。比如在這種情況下，由于內口難以確定，手術操作可能存在一定的不確定性，增加了復發的風險。

二、膿腫切開引流后，膿液排出，膿腔逐漸縮窄但還沒形成肛瘺時，內口范圍不確定，手術的復發率或許會比較高。因為此時內口的具體狀況不夠清晰，手術效果可能會受到影響，導致術后復發的可能性增大。

總之，肛瘺應盡量在瘺管剛形成時就及時進行手術治療，以獲得較好的手術效果并降低復發率。