新生兒眼睛里有頭發可采取以下方法處理。一、沖洗：1.生理鹽水沖洗：新生兒眼睛里有頭發可用生理鹽水沖洗，因其對眼部黏膜刺激小，能將頭發沖出眼瞼外，較短頭發會隨生理鹽水流出眼外。2.人工淚液沖洗：還可使用如聚乙烯醇滴眼液等常見人工淚液進行沖洗，家長可在醫生指導下用這類藥物給新生兒眼部沖洗，也可將頭發沖出。二、工具取出：若經沖洗無法取出頭發，可能需醫生用鑷子或醫用棉簽幫助取出，以免影響眼部健康和發育，家長不可自行操作以免損傷新生兒眼睛。

在取出頭發時新生兒可能因不適出現反抗行為，所以家長要配合醫生操作。取出頭發后家長要做好新生兒眼部護理，密切觀察眼部變化，若出現異常需及時告知醫生，以防出現眼部感染。

總之，當新生兒眼睛里有頭發時，可根據具體情況選擇合適的方法處理，同時要注意配合與后續觀察護理。