鮮胚移植后并非馬上著床，而是需約兩天時間發育成囊胚。

囊胚移植后，其殼大概經過一天左右會破殼，胚泡逐漸增大形成滋養層細胞，會分泌蛋白酶類激素，作用于正處于分泌期的子宮內膜，共同引發生物化學反應，使子宮內膜出現“腐蝕”性缺陷，進而與囊胚的滋養層細胞構建起血液循環，大約五到六天后完成著床，這就是臨床上多采用囊胚移植的科學依據所在。

移植后，胚胎會著床于子宮內膜，依據胚泡在宮腔內的位置以及滋胚層細胞和內膜上皮細胞接觸與結合的程度，通常將著床分為中央或表面著床、偏心著床或完全侵入著床。