腎結石碎了之后還會痛，一般情況下和結石未完全排出、結石碎片排出過程、并發癥等有關。

1.結石未完全排出

體外沖擊波碎石或其他治療方法可能無法將結石完全擊碎或排出體外，殘留的結石可能會刺激腎臟或輸尿管，導致疼痛。

2.結石碎片排出過程

即使結石已經部分或完全排出，在排出過程中也可能會引起疼痛。碎片可能會刺激輸尿管，導致平滑肌痙攣和局部炎癥反應，從而引起疼痛。

3.并發癥

在碎石過程中或之后，可能會出現一些并發癥，如腎絞痛、血尿、感染等，這些并發癥也可能導致疼痛。

如果腎結石碎石后仍有疼痛，應及時就醫，進行相關檢查，如超聲、CT等，以確定疼痛的原因。醫生會根據具體情況采取相應的治療措施。