間質瘤通常是指胃腸道間質瘤，不一定是癌癥。

從生物學行為上，胃腸道間質瘤可從良性進展至惡性，并且多認為微小胃腸道間質瘤（直徑小于1厘米）或者小胃腸道間質瘤（直徑小于2厘米）屬于良性腫瘤。但是如果發現較晚、治療不及時，胃腸道間質瘤有可能會逐漸進展，變為惡性腫瘤，即癌癥。

針對胃腸道間質瘤，需給予個體化的綜合治療，常用的治療方法包括手術治療、介入藥物治療、放療或者化療等。