痔瘡手術三個月后大便疼可能與創面未完全愈合、肛門狹窄、肛裂、痔瘡復發等原因有關。建議盡快就醫，明確疼痛的原因，遵醫囑治療。

1.創面未完全愈合

痔瘡手術后，創面的完全愈合通常需要4～6周的時間。如果手術三個月后大便仍有疼痛，可能是由于創面未完全愈合，大便通過時摩擦創面導致的。

2.肛門狹窄

痔瘡手術后，肛門可能會出現狹窄，導致排便困難、大便疼痛等。

3.肛裂

肛裂是肛管皮膚裂傷后形成的小潰瘍，排便時會引起肛門疼痛、便血等癥狀。

4.痔瘡復發

痔瘡手術后，如果不注意生活習慣和飲食結構，可能會導致痔瘡復發，引起大便疼痛、便血等癥狀。