自身免疫性疾病的診斷方法包括體格檢查、實驗室檢查、影像學檢查等，分析如下：

1、體格檢查

患者可到醫院進行體格檢查，若關節、肌肉處存在壓痛，肌肉存在一定程度的萎縮，可懷疑患者存在自身免疫性疾病。

2、實驗室檢查

患者還需做血常規檢查，明確造血功能正不正常；做血生化檢查，明確肝腎功能正不正常；做生物標志物檢查，可明確患者自身免疫性抗體、功能蛋白等指標正不正常。

3、影像學檢查

患者還可做超聲、CT、MRI等影像學檢查，可明確身體各處臟器有沒有損傷以及病變的情況，可評估自身免疫性疾病的病變范圍以及損傷程度。