腸功能紊亂是否能自愈，主要取決于其病因和癥狀的嚴重程度。

如果腸功能紊亂是由于情緒不佳、飲食不當、精神過于緊張或焦慮，以及飲食不規律如經常暴飲暴食等因素引起的，那么通常有可能通過調整這些因素而實現自愈。例如，調整飲食習慣，避免食用辛辣、油膩、有刺激性的食物，保持飲食清淡，不暴飲暴食；注意個人情緒，避免長期處于低落的情緒，盡量保持心情愉悅；以及注意個人作息問題，保證每天有充足的睡眠，早睡早起，不熬夜，積極鍛煉等。

如果腸功能紊亂是由于幽門螺桿菌感染等病理性因素引起的，或者癥狀較重，如伴有腹痛、嘔吐等癥狀，甚至引發慢性胃炎、肝硬化等疾病，那么通常無法自愈。這類患者需要及時就醫，在醫生的指導下應用適當的藥物進行治療。