扁桃體結石的治療方法有一般治療、藥物治療、手術治療等。

1、一般治療：患者日常生活中需要保持規律作息，增加飲水量，飲食避免辛辣、刺激的食物，餐后及時用溫鹽水漱口。較小的結石可以使用刮匙輕刮出來，以免出血及感染。

2、藥物治療：沒有對癥藥物治療扁桃體結石，如果結石刺激引起周圍炎癥，可以使用抗炎藥物治療，如青霉素類、頭孢菌素類、大環內酯類等。

3、手術治療：扁桃體結石體積較大且患者有反復發作的扁桃體炎時，可以通過扁桃體切除術消除結石。