咽炎耳朵后面按著疼可能是由于淋巴結腫大、咽炎較為嚴重、侵犯神經等原因引起，具體原因如下：

1.淋巴結腫大

咽炎通常由于細菌侵襲機體引起，耳后淋巴結發生反應，從而生成淋巴細胞吞噬細菌或病毒，直接可引起淋巴結反應性增生，耳后淋巴結腫大，觸之還可伴有疼痛。

2.咽炎較為嚴重

多發于急性咽炎患者，疾病初期患者自發感覺咽部灼熱或發癢，隨疾病發展，嚴重者疼痛感可蔓延至耳后，期間還可伴有全身癥狀，如發熱、畏寒、頭痛等。

3.侵犯神經

由于喉嚨感覺神經較為豐富，與周圍神經存在交叉，其中便包括耳部感覺神經，若咽喉出現炎癥，亦可導致患者耳部出現疼痛，特別是在患者咀嚼時或咳嗽時，疼痛癥狀可進一步加劇。