新生兒肝炎綜合征的治療方法包括一般治療、藥物治療、手術治療等。

1、一般治療

疾病確診后，如果存在不明原因的持續性膽汁淤積，應該注意調整喂養習慣，需在醫生的指導下服用特殊補充劑、配方奶粉等，必要時需要限制飲食，以免導致病情加重。

2、藥物治療

患者需要在醫生的指導下，根據患兒病情用藥治療，常用的藥物有更昔洛韋、熊去氧膽酸、苯巴比妥、ATP輔酶等，有抗感染、利膽退黃、護肝等作用。

3、手術治療

如果患兒存在先天性膽道閉鎖、處于肝硬化失代償期，可以采取手術治療，如肝門控場吻合術、肝移植手術等。