兩個月寶寶拉肚子的治療方法有飲食調理、藥物治療和日常護理等。

1、飲食調理：寶寶拉肚子時，家長應盡快恢復母乳喂養以及原來已經熟悉的飲食，以免因限制飲食或者進食過久而造成營養不良。對于疑似乳糖酶不耐受引起的拉肚子，可以使用去乳糖配方奶粉喂養，以減輕拉肚子的癥狀。

2、藥物治療：可以給予抗感染藥物、生物制劑、腸黏膜保護劑等進行治療，能夠改善拉肚子的現象，促進病情恢復。

3、日常護理：在寶寶拉肚子期間，家長應做好局部皮膚護理工作，保持寶寶肛門皮膚清潔干燥，以免繼發感染。