肛竇炎的病因主要包括細菌感染、飲食不當等。

1、細菌感染

肛腺開口于肛竇處，在正常情況下，肛腺分泌出來的黏液具有保護肛管黏膜、潤滑肛管的生理功能，但受到糞便刺激時，可引起肛瓣損傷、發炎、水腫；當糞便長期積聚在肛竇內，導致肛管腺體受堵，腺體分泌不暢時，會增加細菌感染風險，發生肛竇炎。

2、飲食不當

平時飲食結構不當，經常吃辛辣刺激性、油炸油膩類食物的人群，可誘發肛竇炎；存在長期嗜酒等不良習慣和便秘、腹瀉等癥狀者為肛竇炎高發人群，因為長期大便用力會損傷肛竇、肛瓣，稀便會進入肛竇，引起細菌繁殖，增加肛竇炎風險。