檢查肛門一般可以掛普通外科、肛腸科、結直腸肛門外科等，具體根據患者身體癥狀判斷。

普通外科：普通外科內可以檢查肛門，若患者肛門不舒服并伴隨腹痛、肝臟疾病時，此時可以掛普通外科，可檢查腹部、肛門處病變。

肛腸科：若患者患有痔瘡、肛周膿腫、肛瘺等疾病，并出現肛門墜痛、出血等癥狀，此時可去肛腸科檢查。

結直腸肛門外科：若患者存在結腸息肉、結腸癌、直腸癌等疾病，并伴隨肛門不舒服時，可以去結直腸肛門外科就診。