跑步踝關節疼痛可通過休息、用藥或者手術等方式治療，但要根據個人情況選擇適合的治療方式。

1、休息：如果踝關節疼痛是由于跑步時間過長或者跑步強度過大導致局部出現勞損所致，應該及時休息，還要對局部進行冰敷，緩解疼痛，避免癥狀加重。

2、藥物治療：當踝關節疼痛嚴重時，可通過使用布洛芬、雙氯芬酸鈉或對乙酰氨基酚等藥物進行鎮痛治療；同時可以配合進行超聲治療、體外沖擊波治療以及微電流神經刺激等物理治療來促進局部細胞的代謝和更新，放松肌肉，有利于緩解癥狀。

3、手術：若踝關節疼痛是由于局部骨折所致，手法復位困難者可采用切開復位內固定術進行治療。