新生兒顱內出血后遺癥有腦癱、癲癇、智力低下、視力和聽力障礙，共濟失調等。出血患者中10%到15%發生腦積水，顱內壓增高癥狀可有可無，其中65%的患兒可能停止發展或恢復，智力低下有顱內出血可以影響大腦細胞的正常發育。

因此可影響病兒的智力，輕者表現為運動行為發育，較同齡孩子要差，語言功能障礙和學習成績差，經過適當的治療和教育后生活，學習上可達到初小水平，癲癇病兒搶救僥幸存活下來，腦出血沒有得到及時清除，時間一久，血塊發生機化。

機化血塊存在于大腦內形成一個異常的放電病灶，從而導致病兒發生癲癇，腦性癱瘓，由于嚴重的顱內出血會不同程度地損傷大腦細胞，最終可影響腦細胞的發育，使病兒發生腦性癱瘓。