ERCP取膽總管結石術后的后遺癥常見的有出血、十二指腸損傷、胰腺炎、膽管炎、感染性休克等。ERCP手術當中需要切開十二指腸乳頭，術后創面有可能出現出血。

在手術當中需要插入導絲和導管，此時會造成十二指腸乳頭水腫?；蛘呤遣迦胍裙茉斐赡嫘懈腥?，此時容易誘發胰腺炎、膽管炎，如果不及時采取有效的治療措施，可以引起感染性休克而危及生命。

手術當中需要切開十二指腸乳頭，所以容易導致十二指腸損傷，引起十二指腸穿孔、十二指腸瘺。ERCP取膽總管結石屬于微創手術，相對于傳統的手術，手術的創傷小，術后恢復得快，并發癥比較少，建議患者到正規的醫院就診和手術。