尖銳濕疣可以通過治療清除外在病灶，達到臨床治愈的標準，但一般不能根治，容易復發。目前臨床上治療尖銳濕疣，一般以院內治療、以及院外治療為主；院外治療常用的有咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素軟膏等外用藥，對于治療尖銳濕疣輕癥效果較為明顯。院內治療通常使用稀釋的三氯乙酸溶液局部用藥，還可使用冷凍、微波、激光、電凝等物理療法進行破壞治療，清除外在的皮損。如果范圍較大、以上手段治療效果不佳，也可使用手術進行治療。