腎積水的治療一般情況下采用藥物治療及手術治療兩種方式。藥物治療方式根據病情有多種藥物，若是患者伴有尿路感染的情況，可使用氧氟沙星、阿莫西林等藥物；若是尿路結石導致的腎積水，可使用枸櫞酸氫鉀鈉等溶石藥物；若是患者出現疼痛的癥狀，可使用雙氯芬酸鈉等抗炎鎮痛藥物治療。手術的治療方式包括體外沖擊波碎石、輸尿管鏡碎石取石術、放置雙J管等，積水十分嚴重的情況下，還會采取腎切除術。