不是所有的腸息肉都要通過手術切除，如果息肉直徑在1厘米以內，而且息肉沒有造成其他的影響，患者不伴有明顯的自覺癥狀時，可以暫時不治療，可以定期去醫院做復查。如果息肉直徑超過1厘米，伴有明顯不適癥狀時可以通過手術治療。

結腸息肉要做病理，根據性質大小，是否有蒂。單個息肉可以切除。多發息肉或息肉較大有惡變者，可經肛門肛窺腸鏡進行病理活檢，以除外惡變。低位或長蒂脫出息肉可用肛窺、乙狀結腸鏡、套扎或經肛門直接切除。廣基或多發息肉可經腹、會陰、骶尾部行腸壁腸段部分切除。高位息肉可行纖維結腸鏡高頻電切。息肉有癌變應按腫瘤行根治性切除術。