小孩反復高燒39度大多由于病原體感染引起，比如細菌感染、病毒感染以及支原體感染等，還可能由于免疫力下降以及冷空氣刺激等因素誘發，應入院進行血常規檢查以及C反應蛋白檢查來確診病因。

孩子如果反復高燒39度，建議到醫院做一下輔助檢查和體格檢查。檢查一下血常規和c反應蛋白和甲型、乙型流感。根據現在這個季節，皰疹性咽峽炎和手足口病發病率較高，這兩種病都是病毒感染引起的，主要表現就是發熱，而且是高熱，持續時間較長，一般為5天左右。如果孩子發熱5天以上，就要考慮是別的原因引起的，比如川崎病和支氣管肺炎。