當嬰幼兒便秘時，家長可以順時針按摩其腹部或適量喂溫水等，促進腸蠕動，改善便秘現象。除此以外，病情炎癥者可通過服用益生菌或就醫灌腸等進行治療。平時應注意飲食的合理性，避免攝入熱性或不易消化的食物等。

治療便秘的根本在於改善飲食內容，多補充水份和含纖維素多的食物（如谷物、蔬菜等），同時訓練排便習慣，藥物治療只在必要時臨時使用。幼兒可在每晚睡前服鎂乳每次０．５～１ml/ｋg，或液狀石蠟每次０．５ml／ｋg，也可二藥制成合劑使用，可免單用石蠟油易自肛門漏出。以上藥物可連用３～５日，同時次晨訓練大便。為免吸入，嬰兒不用石蠟油。兒童還可用酚酞每次３mｇ/kg，睡前服。急性便秘或糞塊嵌塞，可用開塞露（甘油和山梨醇制劑）５～１０ml注入肛內，刺激直腸引起排便；在家中可用小肥皂條插入嬰兒肛門通便，也可用小指戴像皮手套蘸少量石蠟油或凡士林，插入肛門通便。灌腸的方法刺激強，易養成習慣，非特殊需要時不采用。